管理工程系源于原吉林省交通学校专业科，1998年吉林省交通学校与吉林省交通职工大学两校合并，而后成立管理工程系。

　　八年来管理工程系发展迅速，由原来的十几名教职员工发展到现在的38名教职员工，由原来的100多名学生发展到现在的1200多名学生，专业也由原来的三个，即会计电算化、信息、交通运输专业发展到现在的8个专业：即电子商务（网络营销方向）、电子商务（网站开发管理方向）、会计与审计、会计电算化、会计（注册会计师专门化方向）、物流管理、物业管理、人力资源管理。

　　在全体管理系教职员工的共同努力下，管理系正在向着更高、更远的目标发展。以下管理工程系的教学组织结构图：